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Corpogen ofrece oligonucleótidos sintéticos producidos por International DNA Technologies – IDT. Los oligonucleótidos están libres de sales y vienen liofilizados.

Cada oligonucleótido es desprotegido y las sales son removidas para eliminar impurezas. Son cuantificados dos veces por espectrofotometría ultravioleta para tener así, una medida exacta del rendimiento. El rendimiento, medido en densidades ópticas (OD) varía con la longitud y disminuye para los oligos más cortos. Todos los oligos son analizados por espectrometría de masas.

Se ofrecen en las siguientes escalas de síntesis y rendimientos:

Escala de Síntesis Longitud Disponible Rendimiento
 Garantizado
nmoles No bases ODs
25 15-60 3
100 10-90 6
250 5-150 15
1000 5-150 45

El tiempo de entrega es de tres semanas, luego de la orden de compra.

Modificaciones y marcajes

Una amplia variedad de modificaciones pueden ser incorporadas a un oligonucleótido. Estas modificaciones o marcajes pueden ir sobre el extremo 5’, el extremo 3’ o internamente.

Algunas de las modificaciones ofrecidas son:

  • Fosforilación
  • Marcajes con Biotina.
  • Marcajes con fluoroforos:
    • 6-FAM
    • TET
    • HEX
    • JOE
    • Cy3
    • Cy5
    • TAMRA
    • Rodamina

Otro tipo de modificaciones diferentes a las anteriores son realizadas a solicitud del cliente.

Purificación

La purificación se recomienda para todos los oligonucleótidos  mayores de 40 bases en longitud y para algunos de los modificados. Igualmente para aplicaciones tales como multiplex PCR, clonaje, mutagénesis y métodos de antisentido y de RNAi.  La purificación adicional mejora significativamente el desempeño del oligonucleótido. Todos los oligos mayores de 60 bases son analizados por electroforesis capilar, para garantizar la pureza final.

Los métodos de purificación son:

  • Electroforesis PAGE, por lo cual se obtiene una alta pureza. Se recomienda especialmente para oligos no modificados mayores de 60 bases.
  • Cromatografia HPLC, recomendada para oligos modificados y no modificados, de hasta 60 bases.
  • Cromatografía de intercambio IE-HPLC, para ciertos oligos largos.

Los rendimientos para oligos no modificados purificados entre 20 y 50 bases en longitud son :

MÉTODO   RENDIMIENTO
100 nmoles 250 nmoles 1000 nmoles
PAGE Purification   1 OD 2 OD 10 OD
HPLC Purification   1 OD 4 OD 20 OD
IE-HPLC Purification   1 OD 4 OD 20 OD

   

 

Para más información contactar a:

 

  

Walter Ocampo Moure
Área de producción en biología molecular
Corporación CorpoGen
Teléfonos: 8050118/19/22 Extensiones 104 - 106
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